一般切削液通过维持一定水平杀菌剂,胺类和pH以抑制真菌生长。但是如果其中某些参数较低,真菌就会繁殖。如果切削液循环不充分,真菌就会在那些区域滋生。如果系统中有些部位切削液不能大范围经常接触;或者由于生产任务不足,停机时间较长,就更容易出现真菌。如果机床清洗时有残留液,这些微生物隐藏在切削液中,会在新的切削液中快速滋生。尤其是真菌,渗透到菌丝内部彻底杀灭真菌需要花费不少时间和精力。
外界污染物如液压油等系统漏油或是日常清理不善,都会给真菌滋生提供极好的食物来源。避免出现上述这些情况是最理想的。由于不能直接接触和渗透入真菌内部,因此杀菌处理相当复杂。市场上有多种杀菌剂可以使用,但是它们成本较高而且使用时要特别注意安全。